橄榄病虫害过去不多，但近年来陆续发现有新的病虫害。橄榄病虫害主要有星空木虱、吹绵介壳虫、蚜虫、恶生叶虫、卷叶蛾和煤烟病。在福建，橄榄星室木虱危害普遍，橄榄枯叶蛾危害也相当严重。在广西，危害橄榄的害虫主要是星天牛及金龟子。
1.橄榄星室木虱橄榄星室木虱是近年来新发现的橄榄主要害虫，以若虫、成虫危害新梢嫩叶，吸食汁液，致嫩梢萎缩，新叶畸形、卷缩、黄弱，大量发生时引致落叶，树势衰弱，2～3年内不结果，甚至死亡。若虫排泄物污染枝叶，还诱发煤烟病。每年发生3～4代，世代重叠。卵散生于嫩叶的主脉及其两侧附近，1片嫩叶上常有卵100多粒。若虫密集危害，3～4月开始发生，5月盛发，在福建春梢受害最严重。
防治方法：①冬季清园后喷松脂合剂10～12倍液。②每次新梢期喷药1～2次保梢，用40％乐果乳剂1000～2000倍液，或50％敌敌畏乳剂1000倍液，或25％亚胺硫磷1000倍液。一般春、秋梢各喷1次，夏梢期喷2次。
2.吹绵介壳虫吹绵介壳虫以若虫吸食树体汁液，引致落叶、梢枯，树势衰弱，并诱发煤烟病，影响光合作用。每年发生3～4代，10月秋凉后虫口开始大量增殖，1～4月常大发生，主要危害春梢，随着气温升高，虫口密度下降，盛夏初秋虫口大大减少。
防治方法：①苗木检疫，不把害虫带入果园。②结合清园，剪除虫枝，集中烧毁，并喷松脂合剂10～12倍液。③新梢期喷药防治，用50％马拉硫磷600～800倍液。春梢期喷2次，秋梢期喷1次。④保护和利用天敌防治。小红瓢虫和澳州瓢虫都是吹绵介壳虫的天敌，可引进、保护进行防治。
3.蚜虫蚜虫也是危害橄榄新梢的主要害虫，以若虫和成虫群集于嫩梢嫩叶上吮吸汁液，使新梢黄萎，新叶卷缩，阻碍生长，影响树势，也诱发煤烟病。全年均有发生，尤以干旱季节发生、危害严重。
防治方法：①新梢期喷杀。有蚜虫时，可用50％马拉硫磷1000倍液，或25％亚胺硫磷1200倍液，或80％敌敌畏2000倍液，或辟蚜雾2000倍液，或鱼藤精、烟碱等植物性农药。②保护和利用天敌。瓢虫、草蛉、食蚜蝇和蚜茧蜂是蚜虫的重要天敌，若园中天敌数量多时，可不喷药或少喷药，以保护天敌。
4.恶性叶虫橄榄恶性叶虫为小甲虫，幼虫喜食橄榄嫩芽、嫩叶，又因分泌粘液及粪便污染幼叶，使幼叶枯焦。成虫危害嫩梢、嫩叶、花和幼果，影响产量。每年发生6～7代，成虫于树干裂皮处、地衣和苔藓下、杂草、卷叶中越冬，3～4月交配产卵，4～5月孵化第一代幼虫，危害春梢且最严重。防治方法：①清除苔藓、地衣、卷叶和杂草，消灭越冬成虫。②在树干上捆稻草诱集下树化蛹的老熟幼虫，及时取下烧毁。③盛孵期喷药保梢，可用50％马拉硫磷1000倍液。春梢期喷2次，夏梢期喷1次。
5.卷叶蛾橄榄卷叶蛾以幼虫取食新梢叶片，蛀食花果，造成大量落花落果，是新发生的重要害虫。每年发生6代，以幼虫和蛹越冬。成虫产卵于叶上，花期及幼果期盛孵，谢花后集中危害幼果。1龄幼虫咬食果皮，常吐丝将幼果系于叶片或小枝上，53龄幼虫钻入幼果蛀食，当幼果变黄、将落前，又转果危害。
防治方法：①冬季清园，修剪虫枝，清除枯枝落叶，减少越冬虫口。②谢花后期摇枝摇落花瓣，减少幼虫潜伏场所。③虫口密度大的果园，在幼果期喷药，可选用50％敌敌畏1000倍液，或90％的敌百虫1000倍液，或50％杀螟松1000倍液。④人工捕杀幼虫，摘除卵块。
6.橄榄枯叶蛾橄榄枯叶蛾又名鸡尖丫毛虫，在海南岛～危害鸡尖树，在福州、潮安等地危害橄榄，是新出现的橄榄害虫。幼虫取食叶片，危害相当严重。每年发生两代，3～4月幼虫活动危害，白天群栖于树干，夜间食叶量较白天为大。5月中旬老熟幼虫作茧化蛹，6月中下旬成虫羽化，6月下旬至7月上旬新一代幼虫发生危害。初龄幼虫灰褐色至黑色，老熟幼虫灰褐色，体长60毫米左右。
防治方法：①利用幼虫白天群集于树干的习性，集中捕杀。②喷50％敌敌畏1000倍液，或90％敌百虫1000倍液，或50％杀螟松1000倍液。③在湿度大的条件下，可施用白僵菌或苏云金杆菌。
7.煤烟病煤烟病也称烟霉病，是真菌必性病害，发生于枝叶和果实上，初呈暗褐色霉斑，继而向四周扩展成黑色霉层，呈煤烟状，易脱离。该病只在介壳虫类、蚜虫和星空木虱危害较严重的果园发生，因上述害虫的分泌物可作为霉菌的“培养基”，当空气中的病原孢子散落到这些分泌物上时，便迅速繁殖。荫蔽和潮湿的环境有利于该病的发展。
防治方法：①防治好吹绵介壳虫、星室木虱有蚜虫。②冬季清园后，喷石硫合剂0.8～1波美度。③适当修剪，以利通风透光。④喷药保护。常用的杀菌剂有1％波尔多液(硫酸铜、生石灰各1公斤)，50％甲基托布津800倍液，50％多菌灵800倍液。
