小麦种子在收获后到播种前正处于高温、多雨、贮粮害虫多发时期，正确保存小麦种子应做到三防。
一、防混杂。对于尚未加工包装的毛种子，在贮藏、晾晒过程中很容易造成品种混杂，正确方法是做到单晒，单贮，并做好标识，一旦出现混杂，即作“转商”处理。
二、防霉变。小麦种子在贮藏过程中，水分过大，温度过高易引起霉变，影响种子发芽率。安全贮存条件是水分≤12％，常温贮藏。
三、防虫蛀。危害小麦种子的害虫有很多种，但以玉米象和麦蛾为最多。目前防除方法主要以药剂防治为主，常用磷化铝或磷化锌片剂进行密闭熏蒸。用量为每500公斤种子3-4片（每片4克），库内熏蒸为每立方米5克左右。
