症状 俗称棉花黑根病、烂根、腰折病。主要为害棉苗。侵染幼茎茎基部初现纵褐条纹件适宜时迅速扩展绕茎一周，缢缩变细，出现茎基腐或根腐。棉苗失水较快，一般不倒伏。死苗易从土中拔出，其基部或根系上可见稀疏的丝状物及粘附在其上的小土粒。侵染种子引起烂种或烂芽，病种子多呈褐色软腐状，挤压时流出共黄褐色粘液。侵染子叶及幼嫩真形成不规则褐色坏死斑，后干枯穿孔。湿度大时病部可见稀疏白色菌丝体，并有褐色的小菌核粘附其上。
病原 Rhizoctomia solani Kühn AG-4称立估枯丝核菌AG-4菌丝融合群，属半知菌亚门真菌。有报道AG-5、AG-1-IA等少数融合君也可侵染、致病，但不引起死苗。AG-4寄主广泛且致病力很强，除侵染棉花外，还侵染水稻、小麦、玉米、花生、芝麻等。试验将棉花立枯病菌、小麦纹枯病菌分别接种于小麦和棉苗上，并不相互侵染，所以，其它寄主上的AG-4与棉苗的关系还需进一步明确。该菌有性态为Thanatephorus cucumeris (Frank) Donk称瓜亡革菌，属担子菌亚门真菌。
传播途径和发病条件 病菌主要以菌丝体和菌核在土壤中或病残体上越冬，较少以菌丝体潜伏在种子内越冬，但收花前遇低温多雨年份棉铃染病时，病菌侵入铃内，造成种子带菌，成为翌年初侵染源。在棉田病菌多集中在6cm以内的表土层，可存活2-3年。病菌遇适宜条件和寄主，菌丝贴寄主表皮细胞形成侵染垫，然后伸出侵染线侵入细胞为害，也可从伤口及自然孔口侵入，菌丝扩展引致组织坏死变褐，病死植株的皮层缚织充满菌丝和菌核成为重要的再侵染源。病菌借流水、地下害虫及农事操作传播。阴雨多湿天气利于立枯病发生。此外，生产上地势低洼或土质粘重的棉田易发病；播种过早、土温低、幼苗生长缓慢及排水不良发病重。
防治方法 (1)选用抗病品种。如晋棉16号(师棉5号)、晋棉21号等。进行大面积合理轮作。(2)提倡施用酵素菌沤制的堆肥或腐熟有机肥及5406菌肥。精细整地，提高播种质量。(3)播种前精选棉种，并用种子重量0.5%-0.8%的50%多菌灵可湿性粉剂或种子重种。(4)提倡采用脱绒包衣棉种，可提早出苗3-4天，减少发病。(5)适期早播，春棉花应在5cm深处土温稳定在14℃时播种，播深4-5cm。(6)加强苗期管理，适当早间苗，适时早中耕，注意降低土壤湿度，提高地温，培育壮苗，雨后注意排水，防止湿气滞留。(7)出苗后病害始发期，用80%退菌特或20%稻脚青可湿性粉剂1000倍液灌根，或用25%多菌灵可湿性粉剂500倍液喷棉苗2-3次。
