雨季是棉花生长发育最旺盛的时期，也是决定棉花产量与质量的关键时期。但是，此阶段天气变化大、灾害频发，常常给棉花生产造成一定危害。生产实践证明，要夺取棉花优质高产，必须在进入雨季后加强管理。
1、适期化控：进入雨季后，棉株极易疯长，引起蕾铃脱落，及时用缩节胺或助壮素化控可稳定棉株生长，改善株形，多结蕾铃。方法是：雨季初期棉花初开花时，每亩用助壮素6-8毫升或缩节胺1.5-2克，加水25-28公斤喷雾。雨季中期（约7月底8月初），每亩用缩节胺3克左右，加水30-40公斤喷施。喷施缩节胺要求每株顶部和果枝顶部着药均匀，水量少，以不滴水为准。一般在下午3时以后或上午10时以前喷施，以防高温蒸发。喷后遇大雨应补喷，用量减半。
2、控制肥水：进入雨季，棉株既长枝叶又增蕾结铃，对肥水的要求达一生高峰，应适时追施肥料，防止脱肥早衰。雨季雨水充足，有利于各种肥料发挥肥效，导致棉株旺长、疯长。对底肥充足，苗肥量大的棉田，应少施或不施肥料，并注意清沟沥水，严防渍涝；对棉株发育迟缓，红茎到顶，叶小色黄的棉田宜早施并加大肥料用量，如尿素用量为每亩8公斤左右。另外，若发生连续干旱，土壤含水量低于田间持水量的60%，应适时灌水。
3、去赘芽打顶心：雨季棉株生长快，赘芽也易发生。雨停间隙应及时将赘芽抹掉。棉株长至预定株型，有预定的果枝数时，为打破和抑制顶端生长优势，减少上部无效果枝对养分的消耗，促进棉铃发育，应适时（约7月中下旬）打顶。
4、防治病虫害：各种病虫害的发生与否，和雨季雨量状况关系极大。干旱不利于棉铃虫卵的孵化和幼虫发育，降水多、雨量大也会阻碍其卵的孵化，尤其是暴雨对虫卵及初孵幼虫有较强的冲刷作用。若雨季降水少而均匀，则有利于棉铃虫暴发。雨季降水少、干旱严重，有利于红蜘蛛繁衍危害。雨季出现连续阴雨，棉株疯长且严重，田间排水不良，极易发生枯黄萎病，也容易出现烂铃。棉花病虫害的防治，应结合雨季的天气和病虫害发生情况，合理选择农药。
5、及时应对自然灾害：进入雨季后，干旱、涝渍、冰雹、大风等灾害极易发生，要在加强防御的基础上，对无法抗拒的灾害，及时采取措施加以挽救，以减轻危害。雹灾发生后应及时灌水施肥，促进棉花尽快恢复生机，并及时整枝打顶、化控，防治病虫害。受涝灾后，及时清理、疏通排水系统，排除积水；及时中耕松土，增施速效肥，防止脱肥早衰；适时防治病虫害。
