棉花苗期管理措施，应克服自然灾害带来的不利影响，注意改善生长发育环境，实现壮苗早发。
及时查补：定苗保密度当棉苗出土或体苗移栽到大田里后，要及早查苗。如发现缺苗断垅，要立即补苗。一般先补苗，后定苗。可采取雨后带土移栽和芽苗移栽等方法，尽量补足密度。在此基础上，及时进行定苗，一般每穴只留一株，去弱留壮，减少养分消耗，培育壮苗。
防治病虫害：苗期病害主要有立枯病、炭疽病、红腐病等，遇到低温阴雨天气常大发生，造成病苗或死苗。加强田间管理，雨后及时中耕，松土散湿，提高地温，可以抑制苗病的发生与发展。苗床喷施1:1:200波尔多液，或65%代森锌250?/FONT 500倍液，或多菌灵1000倍液，或撒施草木灰等都有较好的防病护苗效果。
虫害：春棉蚜虫发生重，红蜘蛛、蓟马、玉米螟发生轻；麦套棉则相反。防治应根据实际发生情况，有所侧重。可用久效磷、甲胺磷7?/FONT 10倍液涂茎；或200倍液滴心；或采用0.6毫米小孔喷叶盖、托顶心和嫩叶。既治蚜虫、红蜘蛛、蓟马，又兼治玉米螟、地老虎、棉铃虫。
适时中耕灭草（茬） 春棉苗期中耕，以锄草和雨后松土散湿为主。天气干旱中耕易浅，雨后中耕易深。麦套棉收麦前后无雨，收麦后应先浇水，后中耕灭茬；降雨墒情好，要抓紧中耕灭茬，破板结，松土壤，促使根系下扎，棉苗早发快长。
浇水：春直播棉（包括地膜棉）苗期不遇特别干旱，一般不需浇水，促使根系下扎，利于蹲苗，但麦套棉共生期间小麦耗水量大，土壤板结严重，收麦前后不降透雨，收麦后要抢浇保苗水，防止因高温干旱大量死苗。浇水的时间越早越好，对弥补共生期间损失，尽快恢复正常生长非常重要。浇水晚了，棉苗恢复生长慢，必然迟发晚熟减产。
合理施肥：春棉在施足底肥的情况下，苗期一般不需再施苗肥。但麦套棉在套种或套栽时，因不便施肥，一般都没有施底肥；加上小麦耗肥量大，收麦后棉田严重缺肥，结合中耕灭茬、浇水、及时施肥补充养分，对促壮苗早发，早搭丰产架子十分重要。一般可亩施尿素7.5公斤左右。为创高产，最好结合中耕灭茬，亩深施土杂肥1000?/FONT 1500公斤，饼、磷肥各30?/FONT 50公斤，钾肥15公斤和适量微肥，效果会更好。
