本病根据流行病学特点、症状和病理变化可作出初步诊断，血常规检查有助诊断，但最终的确诊需要作病原学和血清学等方面的工作。
（一）病毒分离： 病毒的分离培养是CIAV鉴定中最常用的方法。肝脏含有高滴度的病毒，是分离CIAV病毒的最好材料，可将肝脏制成匀浆，离心取上清液，加热70℃ 5min或用氯仿处理去除或灭活可能的污染物，用于雏鸡、鸡胚或细胞培养接种。
1.接种雏鸡： 1日龄SPF雏鸡是初次分离CIAV最特异、最可靠的动物实验方法。用肝脏病料1∶10稀释肌肉或腹腔接种1日龄SPF雏鸡,每只0.1ml，观察典型症状和病理变化。
2.接种鸡胚： 用肝脏病料卵黄囊接种4～5日龄鸡胚，无鸡胚病变，孵出小鸡发生贫血和死亡。
3.接种细胞培养物： MDCC-MSB1常被作为体外分离鉴定CIAV的主要细胞。病鸡的肝、脾、胸腺、骨髓等均可作为分离病毒用的病料。初次接种病料的细胞看不到细胞病变，一般须经过5～6次盲传后，可见感染细胞肿胀、边缘破裂，死亡细胞逐渐增多，最后细胞大部分死亡，表明有CIAV感染。
(二)血清学诊断： 目前已建立的CIAV血清学诊断技术有VN、IFN、ELISA，可用于检测感染鸡血清中的抗体。其中，ELISA是检测CIAV抗体的一种良好的血清学方法，其敏感性高，操作简便、快速，所需血样少，可以同时检测大量样品，利于大规模普查。近年来以重组VP1、VP2、VP3做为包被抗原建立的ELISA技术取得了重大进展，可用以检测CIAV抗体。与传统的全病毒抗原相比，重组抗原更具优势。可用免疫荧光抗体试验和免疫过氧化物酶试验检测发病鸡组织或细胞培养物中的病毒抗体。
(三)分子生物学诊断： 目前有许多分子生物学方法，如核酸探针技术和PCR等技术，用于组织或细胞中病毒的检测，其敏感性和特异性都比较高。
(四)鉴别诊断： 该病应该与成红细胞引起的贫血、MDV和IBDV感染、腺病毒感染、球虫病以及高剂量的磺胺类药物和真菌毒素中毒进行区别。
