1.非传染性致病因子
鸡舍通风换气不良，排风口大而进风口小，导致鸡舍内空气稀薄缺氧，有害气体如硫化氢、氨等浓度过高，刺鼻熏眼；舍内空气湿度小，垫料湿度不够，尘埃飞扬，造成粘膜受损；夜间供温相对集中，为保温而不敢通风，忽视了空气和垫料的湿度；雏鸡3周龄～5周龄期间，免疫接种频繁，应激因素增多；不正确的免疫接种，尤其是传支和新城疫的免疫间隔时间过短，引起严重的呼吸道病，而这种疾病和临诊感染十分相似，又被认为是野毒感染发病而错误处置，使问题更加糟糕。
2.传染性致病因子
2.1支原体MG感染是极其重要的因素。从调查情况来看，大多数鸡群发病的最初诱因依然是老病支原体。特别是有些种鸡场没有做过任何的支原体免疫，雏鸡支原体感染严重，表现出明显的呼吸道症状，并且发生早，过程重，继发病多，死亡严重。由于支原体的早期感染，造成呼吸道上皮细胞的破坏和剥脱，细胞的免疫应答低下。这也是虽然在新城疫和传支的免疫上下了很大功夫，但是在发病鸡中依然见到很多新城疫和传支的重要原因。
2.2感染呼吸道综合症的病毒包括新城疫、流感、传支、传支变异株、传喉等。新城疫病毒仍然是最重要的病毒病原。虽然我国养禽业已十分注重对新城疫的防制，但是该病的暴发仍很常见，而且感染的日龄越来越早，非典型表现越来越普遍。
3.大肠杆菌感染
大肠杆菌广泛存在于各鸡场，其中致病性大肠杆菌约占15%。当机体抵抗力下降，支原体开始发作，一方面剥落上皮细胞给大肠杆菌的进入打开门户；另一方面又引起呼吸道发炎和咳嗽，机体丧失抗病能力，使大肠杆菌顺着呼吸道长驱直入。大量细菌在气管或支气管内停留，可以诱发剧烈的炎症反应而出现相应的呼吸道症状；进入肺部的大肠杆菌诱发肺炎，循气囊感染的大肠杆菌又会进一步导致心包炎、肝周炎、腹膜炎或败血症。
