种蛋产出母体外，胚胎发育停止，随后在一定的外界环境刺激下胚胎又开始发育，胚胎发育的临界温度为23.9℃。贮存温度低于这个界限，胚胎处于休眠状态，反之则发育。尽管发育有限，但由于细胞代谢，会逐渐导致胚胎衰老和死亡。收集起来的种蛋，往往不能及时入孵，需要保存一段时间。如果保存条件差，保存的方法不合理，也会导致种蛋品质下降，影响孵化率。因此，应该严格按照种蛋保存对环境、温度、湿度及时间的要求进行妥善保存，以保存种蛋的品质。种蛋保存的条件主要考虑以下几个方面：
1.温度
温度是保存种蛋最重要的条件，种蛋保存的最适宜温度为10～15℃，保存7天以内采用15℃，超过7天的以11℃为宜。如温度低于0℃以下，种蛋会因受冻而失去孵化能力。因此，在孵化前种蛋的保存温度不能过高或过低。
2湿度
蛋内水分通过蛋壳上的气孔不断向外蒸发。种蛋保存湿度过低会使种蛋内的水分蒸发加快，气室增大，蛋失重过多，势必影响孵化率；湿度过高，易引起蛋面回潮，种蛋容易生霉。鸭种蛋保存的适宜的相对湿度保持在70%～80%为宜。
3.翻蛋
为防止胚盘与蛋壳粘连，避免影响种蛋的品质和胚胎早期死亡，保存时间在1周内可以不必翻蛋，超过1周应每天翻蛋1次。翻蛋时，只要改变蛋的角度就可以，比如改变蛋架车角度。
4.通气
保存种蛋的房间要保持通风良好、清洁、无特别气味。种蛋也要防止阳光直射、蚊蝇叮吮。
5.保存时间
种蛋保存的时间与孵化率成反比，即保存时间越长，孵化率越低。种蛋保存的时间可根据气候和保管条件而定，春季最好不超过7天，夏季不超过5天，冬季不超过10天。
6.保存条件的调节
鸭在持续生产过程中，所产种蛋除大小、蛋重发生变化外，结构也发生曲线变化，尤其是蛋壳、蛋清的变化更为明显。根据种蛋的物理特性，将种母鸭的产蛋周期划分为3个时期，即产蛋前期、产蛋中期、产蛋后期。依产蛋期不同采取不同的贮存条件，才能充分发挥种蛋的孵化潜力。
⑴产蛋前期。母鸭刚开产或开产不久，蛋形较小，但钙的摄入量在产蛋率45%～55%时即达到高峰。因此，该时期蛋壳厚、色素沉积较深，且有质地较好的胶护膜，但此阶段的蛋白浓稠，不易被降解。种蛋在孵化期间表现为早期死胎率高，雏鸭质量差，孵化时间相对较长，晚期胚胎啄壳后而无法出雏的比例高。此阶段的种蛋能贮存较长时间，较长的贮存时间能改进孵化率，若只贮存1～3天，则贮存的湿度要降低，不要超过50%～60%。
⑵产蛋中期。该产蛋期内，蛋壳厚度、胶护膜以及蛋白质量为最佳。对于此阶段的种蛋，贮存期在1周以内的种蛋，温度为18℃、相对湿度为75%的贮存条件较为合适。超过1周时间的保存，则须降低贮存温度，提高湿度，才能收到良好的效果。
⑶产蛋后期。与前期和中期相比，蛋白的胶状特性已减弱，蛋壳也变薄，这时的蛋如果贮存较长时间孵化，孵化初期就容易失水，造成早期死胎率高。产蛋后期的种蛋建议贮存时间不要超过5天，降低贮存温度，保持在15℃左右，提高贮存相对湿度到80%。总之，这段时间的种蛋贮存期应尽可能缩短。
