仔猪容易患病
炎热的夏季出现高湿酷热，对公猪和母猪是十分不利的；而如果在低温季节出现潮湿或阴冷,对仔猪也是十分不利的。
秋季的白天，温度并不低，但到了夜间，温度会低很多，往往会低于仔猪所能承受的温度，长时间的低温环境会造成猪抵抗力的降低，甚至发病。
另外，秋天白天变短，太阳光的消毒功能下降，对病的预防作用减弱。特别是阴雨天气，几乎没有太阳，就更不用说靠紫外线消毒了。
饲料容易发霉
阴雨天气饲料容易发霉是正常现象，这一点人们都会注意。
阴雨的秋季防止饲料发霉，有两个办法：一是在库房里储存部分陈旧玉米，至少可以使用半个月；二是注意玉米的保管，因为玉米发霉除湿度大外，还有一个因素是玉米粒间缝隙太小，无法将水汽和热量散发出去，如果我们将玉米过风过筛，人为地增加玉米粒间缝隙，通风良好，发霉就会减轻。北方地区人们采用的舍外储存罐就可有效防止玉米发霉。
蚊蝇的危害仍然存在
尽管气温开始降低，夜间苍蝇不再活动，但白天的活动量仍然很大，而且这时的苍蝇喜欢在夜间到温度更高的猪舍里躲避，从外面带进病菌的可能性更大。另外，蚊子会因为雨水的增加而大量繁殖，传播疾病的可能性更大。特别是对乙脑敏感的公母猪更应引起注意，因为按常规乙脑免疫一般是在四五月份，到九月份时疫苗的抗体已经下降，也可能部分猪的抗体量已经不足以抵抗病毒的侵害。
所以，阴雨的秋季，要继续加强对蚊蝇的防范意识。
呼吸道病开始增加
秋季，昼夜温差变大，往往是疾病发生的导火索。气候变化首先容易引起的是感冒，而感冒没有得到及时治疗的话可能引发支气管炎或肺炎，这样呼吸系统的免疫功能下降，有害病菌等就容易侵入机体，引起面积更大、危害更深的传染病疾病，进而引起全群感染。
所以，预防秋冬季呼吸道病，首先要从防止感冒开始，更为重要的是从预防环境突变开始。