1.消毒剂的选择原则一种理想的消毒剂应该首先是对该猪场发酵床中的菌种没有或有很轻微的杀灭作用的。其次是无臭，性质稳定，可溶于水，使用方便，价廉易得；抗菌谱广，杀菌能力强；作用迅速，有效寿命长，具有较高的脂溶性和分布均匀的特点；对人、畜安全；不易燃、易爆；储存方便；对金属衣物等无腐蚀作用。
一般认为，卤素、酚类、醛类及氧化剂，对各类病毒芽孢及霉菌均有效；亲脂病毒对常用的大多数消毒剂敏感，都能被抑制或杀死；亲水病毒，对消毒剂都具抵抗性，某些消毒剂无效。
2.微生物对消毒剂的敏感性
不同的微生物对不同类的消毒剂的敏感性不同，应该根据养殖场周围的微生物流行特点及消毒目的选择消毒剂。如革兰氏阳性菌比革兰氏阴性菌对消毒剂更敏感。
3.正确选择消毒处理剂量
一般认为，消毒处理剂量和消毒效果及其副作用都成正比。但是除了酒精外，几乎所有消毒剂浓度越高作用越强，一般常使用对组织不起刺激反应的高浓度消毒液。
通常厂商标示的浓度过低，或有效成分不足，或成分不稳定，从出厂至临用时有效成分已丧失不少。故使用浓度宜比指示浓度稍高。
4.消毒作用时间与理化因素的影响
消毒时必须有足够的作用时间。稀释过的消毒剂要一次用完，并将原液储存于冷暗处。
温度可直接影响杀菌效力，温度升高可以显著增高除卤素外的消毒剂的消毒作用。
氯及酚类消毒剂的消毒效力在酸性时比碱性时好，而阳离子表面消毒剂则正相反，因此消毒剂中一般加有缓冲液。
熏蒸消毒时，环境中的湿度影响消毒效果。
金属离子的存在对消毒效果也有一定的影响。
5.消毒剂的更换
不要永久使用同一种消毒剂，每种消毒剂各具特性，其能杀灭的病原种类也一定。久用一种，可能使一些该剂无法杀灭之病原大量增殖，所以常用复式消毒，定期换用各种不同消毒剂。
6.不能盲目相信消毒的效果
有条件的养殖场可以对消毒效果进行科学的监测。
要充分认识到，在动物疫病的防控工作中，消毒不是万能的，完整的防疫措施，必须配合卫生管理、免疫及药物防治，才能控制疾病发生。（作者：山东省畜牧总站周开锋）