郁金香栽培期间易受腐朽菌核病、灰霉病、碎色花瓣病、腐烂病，蓟马、刺足根螨等危害。
郁金香腐朽菌核病此病危害郁金香的幼苗和鳞茎。幼苗染病后，小叶片一生出即死亡。鳞茎受害时，外部的鳞片发生软腐，并在病部及其附近地表处生出菌核。菌核初为白色，后变褐色，但鳞茎内部仍然是好的。
防治方法：①贮藏鳞茎时，剔除受伤或有病鳞茎，注意室内通风，将温度控制在17℃~20℃。②栽种前进行土壤消毒。③发现植株有病，立即拔除病株。并用80%代森锌可湿性粉剂500倍液喷洒其余植株。
刺足根螨在土中或贮藏期间危害鳞茎引起鳞茎腐烂，造成植株生长不良，叶片发黄枯萎。
防治方法：用50%的乙酯杀螨醇1000倍液喷注于球茎部，可有效防治，或将被害的鳞茎放在稀薄石灰水浸10~15分钟，取出后冲洗干净，也可有效防治此虫。