云南切花产销量连续居全国第一，已成为促进云南绿色经济发展、带动农民增收致富、提升云南形象和国际知名度的特色优势产业。滇中地区已成为全国规模最大的鲜切花生产基地和最具影响力的鲜切花集散中心及价格指导中心。
目前，我国自主研发的新品种，采用了国外品种作为育种亲本，均属“依赖性派生品种”，这将严重制约我国花卉育种及鲜切花产业发展。花卉品种自主创新作为长期战略，是一个产业走向高端并持续拥有市场竞争力的关键。云南省农业科学院花卉研究所针对上述问题，在多年研究积累的基础上，进一步完善了花卉新品种研发与推广技术体系，储备了相当数量的优良候选株系和种质资源，新品种培育的数量和质量步入了快速发展时期。
针对月季、百合的育种目标，补充收集优良种质资源，丰富遗传背景。有针对性地选配杂交亲本，对杂交后代进行定向选择与培育；利用胚挽救技术，克服远缘杂交和部分品种间杂交障碍。采用分子标记及染色体原位杂交等分子辅助育种方法，建立目标性状的分子标记与定向筛选技术，实现种质资源、杂种后代、新品种（系）的定向快速筛选。综合回交转育和分子标记，建立滚动回交与标记辅助选择相结合的花卉目标性状聚合育种技术体系。