舍饲肉羊的疫病防治要坚决贯彻“预防为主、防重于治”的原则。主要措施如下：
1、常年保持羊舍内外的环境清洁，重点是及时清理粪便等污物。
2、每年春秋季各进行一次大型消毒，场地、用具等坚持每周消毒一次。病死羊尸体要深埋或焚烧，严防传染病流行。场门（区）入口处消毒池的药液经常更换，保持有效浓度，并谢绝无关人员入场。羊粪集中处理，可在其中掺入消毒液，也可采用疏松堆积发酵用高温杀灭病菌和虫卵。
3、每年春、秋季各注射羊四联苗（快疫、猝疽、羔羊痢疾、肠毒血症）一次。不论大小羊一律肌肉（或皮下）注射5毫升，对肠毒血症免疫期为6个月，其他病为1年。
4、每年的3月、6月、9月、12月各进行1次全群驱虫。药品有阿维菌素制剂、丙硫苯咪唑等。体外寄生虫可用伊维菌素注射液（每千克体重0.2毫克，皮下注射），体内寄生虫可用丙硫苯咪唑（口服剂量为每千克体重15-20毫克）。
5、外地引入羊只要经严格检疫和驱虫，确认没有传染病时方可进场，并且不要从疫区购买草料。
6、养成平时细心观察羊群的习惯，发现异常羊或发病羊时应立即处理。
7、日常管理中要防止通过饲养人员、其它动物和用具传染疾病，严禁患有结核、布氏病等传染病的人担任饲养员。