1、实行检疫制度。苗木调运必须通过检疫，禁止病区苗木及一切带病材料进入新区和无病区，新开辟的果园要种植无病苗。
2、建立无病苗圃，培育无病苗木，要切实做到①对优良单株进行脱毒（茎尖嫁接脱毒或热力脱毒）并经鉴定证明不带菌；②在网室内建立种质圃；③在隔离地方或在网室内建立无病母本园；④在隔离地方或在网室内建立无病苗圃。
3、发现病株或可疑病株，应立即挖除，用无病苗进行补植。
4、防治柑桔木虱。通过水肥管理控梢以减少木虱繁殖和传播。新梢期喷布1-2次杀虫剂。果园四周栽种防护林带，对木虱的迁飞也有阻碍作用。
5、加强栽培管理，保持树势健壮，提高抗病力。
6、病区改造。对于一些黄龙病发生非常严重，已失去经济价值的果园，应实行病区改造。把整个果园的柑桔树全部挖除，喷杀木虱，然后用无病柑桔苗重新种植，把病区改造为无病新区。