垫料对发酵床养猪来说至关重要。发酵床选用的垫料要具备两个特征：一是碳氮比要大；二是物理特性，即吸水性和透气性要好。
一、垫料主要成分
锯末、稻壳、树皮木屑、粉碎秸秆等占90%，剩下的10%是土和少量的粗盐。要求选用没有使用过化肥农药的干净泥土，盐用量为总材料的0.3%。另外，每吨垫料用益生菌液2～5公斤。一般猪舍中垫料的总厚度为80厘米左右，冬季要厚一些，夏季相对薄一些。垫料厚度最低不能低于45厘米，单个发酵床垫料体积不少于10立方米。
二、垫料制作工艺
1.破碎粉碎。粒径一般控制在5～50毫米为宜。对于树枝等木质性材料，除了破碎之外，还应加以粉碎，以免粒径过粗对猪产生机械划伤。
2.物料混合。将选好的垫料在发酵槽内充分搅拌均匀，再加水搅拌。水分应调至50%～60%，以手用力攥能看见水但不滴水为宜，然后再进行堆积发酵。水可以用洁净的天然水体如河道、水塘中的水，但应确定未遭病原菌或化工污染。边洒水边人工或用搅拌机搅拌均匀。
三、新垫料的酵熟技术
填入垫料池中的混合垫料，需要经过发酵成熟处理，即酵熟。
1.平铺酵熟法。将分层制作好的垫料，上层均匀混合好后，适当按压整平，上面覆盖l层地膜或麻袋等覆盖物。一般夏季5～7天，冬天10～15天，有发酵香味和蒸汽散出即为发酵成熟。成熟后去掉地膜24小时后即可进猪。
2.堆积酵熟法。此法便于机械操作和集中管理。将同菌种混合好的垫料原料堆积成梯形结构，冬季应覆盖透气性好的材料如麻袋等，使其升温并达到保温效果。垫料的酵熟温度一般遵循垫料酵熟过程温度曲线。待温度下降平稳后，摊开垫料有清爽的酸香味，说明垫料已发酵成功，即可将垫料按高度要求铺设。
正常酵熟过程一般在发酵第2天，其垫料温度即可上升到40～50℃，4～7天垫料最高温度可达70℃以上，以后逐渐降温到45℃左右的平衡温度．此时即表明垫料发酵成熟。一般夏天需10天左右，冬天15天左右。
四、垫料日常养护
1.垫料水分管理。垫料的水分维持在37%～45%为宜。若水分含量过高应查找原因并及时修补，同时增加人工翻动次数；若水分含量过低，要及时进行加湿喷雾补水。
2.粪尿管理。生猪有集中定点排泄粪尿的习惯。自然状态下发酵床粪便分布不匀，粪尿集中的地方湿度大，分解速度慢。只有将粪尿与垫料混合均匀，才能保证粪尿在较短的时间内彻底分解干净。通常保育猪可2～3天进行1次粪尿人工疏理，大中猪应该1～2天进行l次。
3.垫料通透性管理。猪只踩踏、物料颗粒分解等因素，会使垫料颗粒细化和实密化，通透性和粪尿分解速率下降。因此，要人工定期与不定期翻动垫料。一般情况下，保育猪翻动10～20厘米，育成猪翻动20～30厘米。一批猪出栏后，需要彻底将降解层翻动1次。
五、菌剂的使用
将菌剂按使用说明的用量均匀地喷洒在物料上，充分混匀后进行填料。以后当发酵床出现异味或恶臭时，可结合补充水分喷洒菌剂，但要翻动物料以保证菌剂在垫料表层分布均匀。
六、垫料的质量标准
通过高温堆制的垫料是否符合发酵床养猪的要求，通常可以通过以下定量和定性的标准来判断：（1）碳氮比30:1～70:1；（2）粪大肠杆菌数在100个／克以下；（3）蛔虫卵死亡率在98%以上；（4）pH值在7.5左右；（5）物料粒径在5～50毫米；（6）物料结构松散，手握物料松开后不粘手；（7）垫料无恶臭或其他异味。