授粉时间一定要拿捏好。由于棚内缺少传粉昆虫，秋茬西瓜通常需要借助人工授粉，且授粉期相对集中。西瓜花冠在凌晨5时左右开始松动，6时左右开始散出花粉，花冠全部展开，至中午时，花冠颜色变淡，开始闭合。上午8～10时是雌花柱头和雄花花粉生理活动最旺盛的时候，此时也是授粉的最佳时间。一般西瓜授粉完成时间以7天为宜，这样西瓜坐果期集中，管理方便，采收期也集中，并且瓜大小均匀，产量高。若授粉完成时间超过10天，则坐瓜不整齐，生长缓慢，影响产量。
授粉温度一定严格管理。西瓜开花坐瓜的适宜温度在25℃～32℃，温度高于32℃会使西瓜花粉的活性迅速降低。另外西瓜授粉后，花粉管发育、完成受精也需要一定的条件，此时的温度也不宜过高。因此，在秋茬西瓜授粉期间，棚内温度要求较为严格，白天最好不要超过30℃，夜间不低于15℃，这样才更有利于授粉、坐瓜，提高坐瓜率，减少畸形瓜。若上午棚内温度达到30℃，要及时通风降温。