果树剪锯口保护不好，会导致伤口愈合能力差，腐烂病侵染严重，对树体造成伤害。多数情况下，腐烂病在剪锯口发生的数量最多。
一、如何保护剪锯口呢？从修剪手法到剪锯口用药各方面都要特别注意。
一.尽量避开绝对低温期修剪。
所谓的绝对低温期指的是三九、四九严寒天气。绝对低温期修剪，会导致剪口冻伤，来年影响养分输送受阻，容易感染腐烂病和缺素症。
二.修建时应注意全树较大的剪锯口的数量和位置，尤其是树干上不要存在过多的较大的伤口，否则会对树势造成影响。
三.去大枝时尽量不要留桩。
留桩过长容易从锯口部位向内腐烂，直至蔓延到主干部位。一般果农认为，留桩长一些，腐烂一段去掉一段，有利于保护主干。其实这种想法是错误的。不留桩就不容易导致腐烂，何必要留桩呢？
四.剪锯口要平滑，不能留有毛边，特别是较大的锯口要用快刀修平，以利于愈合。
五.在使用剪刀疏枝时，一定要大刃在下，小刃的压伤在留下的枝段上，容易招惹腐烂病；小刃在上时，小刃的压伤在去掉的枝段上，留下的枝段剪口是平滑的。
六.对有腐烂病、病毒性花叶病等果树，在修剪时要分别使用不同的剪、锯。在病树上使用过的剪锯再在健树上使用，会导致病害的交叉感染。
七.在修剪后必须涂抹剪锯口进行保护，这次用药很重要。边剪边涂抹封闭伤口，既可防止水分散失，又可避免腐烂病菌侵染，促进愈合。
八.也可伤口粘土保护，将较大的伤口用胶体状的软泥糊严，然后再用塑料薄膜包好，防止病虫害侵入，减少伤口水分散失，利于愈合。
九.对主干或是大枝上的伤口也可于明年春季进行桥接使上下连接，促进愈合。
二、巧妙利用剪锯口：
一.调整枝条方向：根据枝条的生长空间，适当短截促发剪口下的芽，使其改变原枝条的生长方向，迅速生长；对于背上枝或徒长枝，可通过回缩将其改成斜生枝或新的结果枝组，消弱其营养生长优势，缓和树势，促进生殖生长，提早开花结果。
二.调整结果枝组：对于生长过旺的主枝或枝组，在基部多疏枝，多造伤，削弱生长势，减少生长量，来控制枝组生长；在疏除背上、两侧或其他地方的大枝或徒长枝时，如果全部疏除后会形成较大的空间，可以采用留茬疏除。即在被疏除枝的基部留下0.5-2厘米枝段，让其基部萌发小的枝条来占据空间。
三.巧妙利用背上剪口萌芽，防止主干晒伤。在疏除背上大枝时，如果周围过于空荡，夏季很容易晒伤主枝，冬剪时有意留一些短桩，让其来年萌发枝条。这些枝条能起到遮挡阳光的作用，相当于给主枝打上了“遮阳伞”。