贮藏前先挑拣。要对苹果进行仔细筛选，将那些品相差、带病带伤的苹果挑拣出来处理掉，以免引起大量的腐坏。另外，过大或过小的苹果也不能入库，因为过大的苹果组织疏松，呼吸过于旺盛，容易变质。而过小的苹果因为发育不良，抵抗力差，也易腐坏变质。
先预冷再入库。将挑选好的苹果在库外的阴凉处放置一夜，使其渐渐适应库内温度再将其于天亮之前移入库内，这样可以防止温差刺激引起的果品变质。如果需要较长时间的保存，可用保鲜袋将苹果分批盛装，可保存3~5个月。
贮期控好温、湿度。苹果在室温0℃时贮藏时间最长，所以要将库里温度控制在0℃~1℃以内。一般较为细致的管理，温度控制应在-0.5℃~0.5℃；较为粗放的管理，温度也应在-1℃~1℃。湿度方面，应注意及时人工喷水加湿，保持相对湿度在90%~95%。