苹果炭疽病病菌以菌丝体在枝条的溃疡部枯枝及僵果上越冬，借昆虫和风雨进行传播，发病初期，果面出现淡褐色水浸状小圆斑，并迅速扩大。北方地区6～9月份均可发生，以7～8月份为盛发期，特别是雨后高温即发生流行。排水不良的低洼果园和树势弱的果树发病早而重。防治要注意以下几个方面：
及时清除病源结合冬季修剪搞好清园工作，认真清除树上的病僵果、枯枝等。生长季节及时摘除初期病果，防止病菌重复浸染。
加强栽培管理努力改善果园的通风透光条件，雨季及时排水。增施有机肥，控制挂果量，以增强树势，提高抗病能力。同时重视叶面肥的施用，特别是钙肥不可缺少，根据多年经验，在钙肥补充充足的条件下，苹果炭疽病相对发生减轻。
提前预防主要是在套袋前的预防。果树发芽前喷施“灭菌强”（12%腈菌唑）1000倍液，对减少越冬菌源有较好的效果。生长期一般从谢花后10天左右开始喷药防治，进入7月份后对中心病株及重病区要优先用药，连续喷药3～4次。具体喷药时期根据降雨情况而定，坚持雨后喷药，雨多多喷，雨少少喷。
常用药剂有美邦甲托800倍液或“爱慕”（70%甲基硫菌灵）1000倍液或丙森·多1000倍液或“抑菌特”（72%福·福锌）1000倍液交替使用，十天一次。为了兼顾防治其他病害，可同时添加顶端（80%戊唑醇水分散粒剂）8000倍液。