苹果小叶病多发生在可溶性锌流失量大；氮肥用量过多，导致树体需锌量增加；盐碱地pH值较高，锌易被固定，不能被根系吸收。另外，土壤粘重，活土层浅，根系发育不良，小叶病发生重。所以增加锌盐供应或释放被固定的锌元素，是防治该病的有效途径。
增施有机肥通过施加有机肥，改良土壤，增加土壤中有机质含量，可降低土壤pH值，用根施通+微肥灌根，诱导根系对土壤中各种微量元素的吸收利用。施肥后要及时喷施新高脂膜，提高肥效。
植株喷锌结合施基肥，每株树追喂0.1~0.15公斤硫酸锌，施后一般第二年见效，并可持续3年。有小叶病的果树，发芽前树上喷新高脂膜+30倍硫酸锌液肥，对当年防小叶病效果明显。花后3周，发现有小叶病的病株，可用新高脂膜+硫酸锌500倍混合液喷雾。