秋季黄花菜采收后，及时抓好田间管理，可为来年丰产打下基础，其管理要点是：
枯叶茎秆处理8月底全国各地的黄花菜应该都采收完毕了，黄花菜叶茎也会慢慢枯萎，最好能把枯叶茎秆拔出来，当柴火烧掉，如果人手不够可以等茎叶晒干后直接在菜地里点火烧掉，不用担心会烧坏种苗。
深挖翻土秋季深耕翻土能加深和熟化耕作层，增强土壤的通透性，提高土壤肥力。深耕宜在花蕾采收完后进行，宜早不宜晚。
选择晴天土壤干燥时挖土，深度25～30厘米。切断皱缩衰老的根系，促进秋苗增生新根。对栽植3年以内的黄花菜，只可在行间深挖15～20厘米，以防伤根损苗。
管好秋苗黄花菜种苗在10月发芽，是一年中的二次生长。通过秋苗生长和养分积累，以促进蘖芽形成，为来年春芽生长打下基础。
结合深翻土壤每亩地可施尿素7.5～10公斤、过磷酸钙25～30公斤加水150公斤，充分搅匀后淋施。施肥后盖3～5厘米厚的细土，避免肥料流失。
防治病虫害黄花菜秋季易发生红蜘蛛、小地老虎和锈病的危害。红蜘蛛和小地老虎可用1000倍乐果或500倍的辛硫磷防治，每亩每次用药液75公斤，每10天喷一次。锈病可用粉锈宁500～1000倍液连喷2～3次，每隔10～15天1次，每亩每次用药液50～75公斤。