目前，菜农在采收苦瓜时随意性很大，严重影响苦瓜的产量。其实苦瓜的采收应考虑到苦瓜的生长季节、运输时间的长短及运输方式、贮藏时间的长短及贮藏方式等。
采前控水需要长途运输和贮藏的苦瓜，在收获前2～3天停止浇水，可有效增强其耐贮性，减少腐烂，延长采后保鲜期。
适时采收一般就地销售的苦瓜，可以适当晚采收，长期贮藏和远距离运输的苦瓜则要适当早采收；冬季收获的苦瓜可适当晚采收，夏季收获的苦瓜要适当早采收；冷链流通的苦瓜可适当晚采收，常温流通的苦瓜要适当早采收；市场价格较贵的冬、春季，可适当早采收。
防止损伤苦瓜采收时要轻拿轻放，防止机械损伤。机械损伤是采后贮藏、流通保鲜的大敌，不仅可引起蔬菜呼吸代谢升高，降低抗性，降低品质，还会引起微生物的浸染，导致腐烂。.避雨和露水不要在雨后和露水较大时采收苦瓜，否则难以保鲜，极易引起腐烂。
低温采收尽量在一天中温度最低的清晨采收苦瓜，这样可降低苦瓜的呼吸代谢，有利于采后品质的保持。