大蒜软腐病是细菌性侵染病害，病原物是胡萝卜软腐欧氏杆菌，主要通过土壤中病残体上的病原物进行再侵染。秋播大蒜从11月开始发病，田间地势低洼、降雨及浇水多、排水不良、田间湿度大处发病重，阴沟阳畦方式栽培的发病重，抗寒性差的大蒜品种发病重，播种过早及施化肥过多而年前生长过旺的发病重。综合防治应该从播种开始。
1.选用优良蒜种，以脱毒、抗病、无病虫蒜种最佳。
2.宜选择地势平坦、排灌方便、土壤有机质丰富、保肥水能力强、而且前茬为非葱蒜类土壤种植大蒜。并精细整地，做到上松下实，以阻隔病源和规避发病条件。
3.施足腐熟的以磷、钾肥为主的优质有机肥、饼肥，提高植株的抗病能力，以减少生理性病害发生。
4.药剂防治。⑴种蒜处理：播前用种子重量0.25%的2.5%适乐时悬浮种衣剂拌种包衣，可杀灭蒜体病原菌；也可用50%多菌灵或77%可杀得或77%多宁可湿性粉剂拌种，拌种方法是每种药剂100克兑水5公斤，可拌种50-75公斤，均匀拌好晾干后播种。⑵土壤处理：此法适用于已发生软腐病的地块，可用77%多宁可湿性粉剂600倍液喷洒播种沟，每亩喷药液100公斤，喷后即播种；或用硫酸铜、生石灰、草木灰以1∶1∶100的比例混合，撒施于蒜沟内。
5.发病后及早防治。采用以上措施后，一般可防治大蒜软腐病的发生，若仍有发生的，要及时喷药防治。在发病初期用77％多宁600倍液、3％中生菌素800倍液，每7-10天喷1次，连喷2-3次。