扁豆茎枯病是由半知菌亚门真菌侵染引发的病害，主要危害茎部。发病初期在茎部表面生灰色条状或不规则形斑，病斑扩展至茎粗的三分之二以上时，植株往往在下午呈现萎蔫状，早晚尚可恢复，当病部扩展绕茎一周后，可致病部以上或全株枯死，病部变为灰白色至暗灰色，表面生出很多小黑粒点（病菌分生孢子器）。
该病病菌以菌丝或菌核随病残体在土壤中越冬，次年春季条件适宜时产生分生孢子，借雨水溅射传播，孢子萌发进行初侵染，引起幼苗或成株发病，病部产生的分生孢子借风雨传播进行多次再侵染。田间高温高湿、地势低洼及土壤湿度大有利于该病发生。
药剂防治扁豆茎枯病，应选用对半知菌有效的药种，如代森锰锌、噁霜·锰锌、异菌脲等，每亩加水50公斤喷雾，每7天一次，连续防治2～3次，采收前3天停止用药。发病田块清茬时需将病残体集中深埋或统一处理，以减少菌源。扁豆生长期增施钾肥可增强植株抗病能力。