育苗期间要采用保温等措施，每亩苗床播种1公斤左右，播种前用水浇透苗床，播种后覆盖2毫米厚细土，再搭建小拱棚保温。
幼苗出土时洒一次水，2天后苗可出齐。苗出齐后撤去拱棚，小水浇灌，保持苗床土壤湿润即可。等到在3-4片叶时可追施一定的氮肥，4-6片叶时定植。需要提醒的是，定植前把苗床浇透水，以便起苗。
大棚芹菜定植，一般每亩施用农家肥4000公斤、磷肥40公斤、碳酸氢铵20公斤，单株行距10-12厘米定植，定植的深度以按照浅不露根、深不盖苗心为宜。
定植后要加强苗期管理，保持土壤湿润，初期要常浇水，芹菜叶心变绿，长出新根后才开始控制水量，松土保墒，每亩追施硫酸铵25公斤，每3-5天浇1次水。
苗期要加强病虫害防治，斑枯病是芹菜的常见病，可用75%百菌清或70%甲基托布津600倍液喷施防治，每5-7天喷1次。蚜虫和红蜘蛛是芹菜的主要虫害，可用三氯杀螨醇1000倍液喷雾防治。