1.施肥原则
（1）施用充足的底肥满足前期生长对养分的吸收，同时防止生长后期脱肥。
（2）芹菜对氮肥需求量最大，钙、钾肥次之，磷、镁肥相对较少。
（3）注重硼肥施用，芹菜需硼较多，缺硼或由于高温、低温、干旱等原因使硼的吸收受到抑制时，叶柄易发生“劈裂”，出现茎折病，应补施硼肥或叶面喷施多元微肥。
（4）保持土壤水分充足，芹菜是浅根作物，根系不发达，要求土壤相对湿度在90%以上。
（5）芹菜不宜强光直射，尤其是苗期，但充足的阳光有利于生长，减少病虫害发生。
2.施肥建议
（1）基肥施用充分腐熟的农家肥2—3方/亩，或商品有机肥300—400公斤/亩。
（2）产量水平8000—10000公斤/亩，氮肥（N）20—25公斤/亩，磷肥（p2O5）10—13公斤/亩，钾肥（K2O）18—23公斤/亩；产量水平6000—8000公斤/亩，氮肥（N）15—20公斤/亩，磷肥（p2O5）8—10公斤/亩，钾肥（K2O）13—18公斤/亩；产量水平4000—6000公斤/亩，氮肥（N）10—15公斤/亩，磷肥（p2O5）5—8公斤/亩，钾肥（K2O）8—13公斤/亩。
（3）芹菜全生育期需要追肥3—4次，其中20%氮肥、20%钾肥和100%的磷肥作基施，在5—6叶时开始第一次追肥，追肥结合灌溉施入，每次追肥间隔15—20天，每次追肥之间可根据土壤墒情进行一次灌溉，以保持土壤含水量。
（4）根据土壤养分特征和作物养分需求情况，基肥推荐18-20-5（N-p2O5-K2O）或相近配方；追肥推荐15-9-25（N-p2O5-K2O）或相近配方。在低温、寡照等极端环境条下，可添加功能性物质（如氨基酸、黄腐酸、海藻酸等）促根同时增强作物抗逆性。
（5）芹菜生长前期应注重氮肥施用，后期应注重钾肥施用。如缺钙发生心腐病，可用0.3—0.5%的硝酸钙或者氯化钙溶液进行叶面喷施。芹菜生育期叶面喷施0.2%硼砂溶液，可在一定程度上避免茎裂的发生。