辣椒苗嫁接常用劈接法、斜切法，嫁接部位由专用的塑料嫁接夹固定。气门芯法是采用自行车气嘴上使用的气门芯，在农村取材比较方便，最大的优点是嫁接成活率高，而且随着嫁接苗的生长到结果初期气门芯将爆裂自动脱落。
嫁接时，砧木苗龄5～6叶期，接穗4～5叶期，茎粗2毫米左右为宜(因气门芯直径较小)。具体方法：将砧木株高11厘米左右处，45°向下斜切去头；接穗第一片真叶以下1厘米处45°向上斜切。气门芯长0.6～1厘米，先将砧木的斜面一头插入气门芯至中部，然后将接穗套进气门芯的另一头，最后使2个斜切面吻合。在选择砧木、接穗时，尽量选切面处茎粗与气门芯口径相当者。
嫁接后将嫁接苗及时移入小拱棚内，充分浇水，盖上塑料膜，处于密闭状态，7天内不进行通风，温度保持在20℃～30℃，相对湿度保持在95%以上(每天在小拱棚浇1次水)。嫁接后的前5天要全部遮光，以后两侧见光，随着愈合逐渐撤掉覆盖物，8天后适当揭开塑料薄膜，给予通风直至完全成活再转入正常管理。