造成大棚辣椒落花落果的原因主要有1.营养不良。由于栽培不当，而造成徒长，使营养生长和生殖生长失去平衡，使辣椒花、果营养不足脱落，大棚栽培中，辣椒易徒长，因此，落花落果是常见的现象。2.不利的气候条件。冬春季大棚中经常光照不足，温度偏高或偏低，通风不良，湿度较大，这些不利条件导致辣椒花不能正常受粉，易造成落花落果。3.病虫危害。辣椒发病也易引起落花落果，如辣椒感染病毒后常出现死顶现象，造成落花落果，烟青虫蛀果也易引起落果。
防治措施主要措施应从加强管理入手，主要是培育壮苗，适时定植，合理密植，科学施肥，定植后加强通风排湿，保持适当的温度，棚内提倡膜下灌水，勿大水漫灌，注意病虫害防治。