冬季辣椒育苗期间，经常会突然受到寒流的攻击，温度骤然下降，秧苗容易受冻害。如果温度是迟缓下降，则秧苗不易结冰受冻；如温度固然不是太低，但低温延续时间很长，特别是低温与阴雨相伴同，秧苗也很容易发生冻害。秧苗受冻害的轻重，还与低温过后气温回升的快慢有关。如果升柔和解冻太快，秧苗组织易脱水干涸，造成死苗。辣椒苗防冻办法有以下几方面。
改良育苗方法利用人工控温育苗方法，如电热温床和工厂化育苗等，是解决秧苗受冻问题的基本办法。
加强秧苗抗寒力避免秧苗徒长，在寒流来临前尽量揭去覆盖物，让苗多照光和接受训练。在雨雪低温期间，尽量利用气象放晴间隙，揭掉草帘，让辣椒苗能受到阳光照耀。雨雪停后猛然转晴时，中午前后在苗床上盖几块草帘，避免秧苗失水萎蔫。床土湿度大，秧苗易受冻害，所以寒潮来临前要节制苗床浇水，床土过湿的可撒一层干草木灰吸湿。
合理施肥增施磷钾肥，苗期使用抗寒剂。秧苗喷施0。5％―1％的红糖或葡萄糖水，可加强抗寒力。在3―4叶期喷施2次（间隔7天）0。5％氯化钙溶液，可加强抗寒性。
保温防冻寒潮期间紧密覆盖苗床。进行短时间通风换气时，要避免冷风直接吹入床内伤苗。夜晚加盖草帘。可将稻草枯叶撒在秧苗上，寒潮过后再消除。苗床上盖的草帘应单调。下雪天雪停后，及时将雪消除出育苗场地。