温度管理重点是作好防寒工作，将温度控制在辣椒适宜的生长温度。将一天的温度管理分为几个时段，上午揭开草苫以后，使温度迅速提高，维持在25℃-30℃，不超过30℃不放风，上午辣椒的光合作用强度高。下午1点以后，呼吸作用相对提高，此时的重点是抑制呼吸作用，通过适当的放风，使温度降低，维持在20℃-23℃。前半夜管理的重点是促进白天光合同化物的外运，此时辣椒植株进行呼吸作用，促进同化物外运的适宜温度是18℃-20℃。到后半夜，管理的重点是尽可能地抑制呼吸作用，减少养分的消耗，温度控制在15℃左右。
湿度管理湿度过高易导致辣椒各种病害高发，必须除湿。除湿最好的方法是采用膜下灌溉的浇水方式。浇水的时间选择在上午，这样有利于地温的回升和排湿。排湿的方法是在浇水以后，不放风，使室内的温度迅速升高，地表的水分蒸发，空气的湿度提高，1小时后迅速放风10分钟，放风口要大，时间不可长，而后关闭放风口，再重复一遍这样的操作。2-3次以后，地表的湿气基本可以排除。