辣椒绵腐病主要为害果实。果实发病，发病初期产生水浸状斑点，随病情发展迅速扩展成褐色水浸状大型病斑，重时病部可延及半个甚至整个果实，呈湿腐状，潮湿时病部长出白色絮状霉层。
苗期，成株期均可发病。苗期发病，幼苗基部腐烂，缢缩猝倒而死。成株期主要为害果实。果实发病，病部褐色湿腐，湿度大时病部长出白色致密絮状霉层。重时整个果实发病最后腐烂。
段防治方法
1、选择地势高燥，排水良好地块种植。地势低平，应高畦栽培，最好地膜覆盖。
2、注意密度不要过密、及早搭架，整枝打权，中期适度打去植株下部老叶，降低株间湿度。
3、合理施肥，避免偏施、过施氮肥，增施钾肥、雨后排水，确保雨后、灌水后地面无积水。
4、发病初期药剂防治，可用25%甲霜灵可湿性粉剂800倍液，或64%杀毒矾可湿性粉剂500倍液，或40%乙磷铝可湿性粉剂300倍液，或58%甲霜灵锰锌可湿性粉剂500倍液，或72.2%普力克水剂600倍液，或72%克露可湿性粉剂500倍液，或77%可杀得可湿性微粒粉剂600倍液，或30%绿得保胶悬剂500倍液。