一、辣椒枯萎病
辣椒枯萎病为真菌性病害。发病初期辣椒叶片变黄，后期植株迅速凋萎，根部及茎基部皮层变褐色坏死腐烂，木质部暗竭色，高湿时对病部产生蓝白色霉状物，坏死部位从外向里发展，无菌浓。此病在雨多湿度大的条件下容易发生。
防治用药：先清除病株，再用枯萎灵、可杀得、多菌灵等灌根2~3次，每株灌药液500g。
二、辣椒青枯病
辣椒青枯病为细菌性病害。发病初期生长点附近叶片突然萎蔫，夜间恢复，后期全株青枯状枯焦。病株茎根维管束变褐色腐烂，将病茎插入透明玻璃杯水中，可见乳白色粘液溢出，即病原细菌。青枯病属土传性病害，多从根部伤口浸染。
防治上应注意：1、实行水旱轮作。2、酸性土施石灰改良土壤。3、清除病株。药物防治可用硫酸链霉素等灌根2~3次。
三、辣椒根腐病
辣椒根腐病属真菌性病害。发病初期白天枝叶萎焉，傍晚至清晨恢复正常，后期全株枯萎，根部皮层褐色腐烂，极易剥离，木质部暗色。
防治用药：根腐灵、多菌灵等灌根2~3次。
四、生理性枯萎
1.因积水引起根部呼吸困难窒息腐烂而枯萎。
2.施肥浓度过大或粒状肥施近茎基部引起烧根茎而导致枯萎。
3.干旱失水引起枯萎。