小白菜在贮藏中损耗的原因主要有失水萎蔫、黄化和腐烂。失水萎蔫主要是由于空气相对湿度低引起的；黄化主要是由于贮温过高、呼吸消耗大引起的；腐烂主要是由微生物侵染引起的，多发生在贮藏后期。
小白菜贮藏病害中软腐病造成的损害较严重，软腐病有由细菌引起的，也有由真菌引起的。为了减少小白菜在贮藏中的损失，在采前要保持菜表面的干净卫生，并在收获前2~7天使用杀菌剂扑海因或苯菌灵进行喷洒。同时用0.004%的防落素溶液沿菜帮茎部向上均匀喷雾，可防止贮藏中脱帮。
贮运中小白菜的包装最好用聚苯乙烯泡沫箱或瓦楞纸箱装，用纸箱包装的，箱内需用塑料薄膜作为内包装，也可在码垛后再在垛上覆盖一层塑料薄膜帐，以较好地保持空气相对湿度。但不论使用哪种包装箱，都应在包装前将包装箱放入冷库中冷却。无冷藏设备的短期贮运，也可在泡沫箱内放置一层冰块（用塑料袋装好），尽可能使温度维持在10℃以下。