茄子无公害生产应以有机肥为主，有机肥既可改善土壤结构，增加土壤透气性，促进植株根系发育，又可避免因施用化肥而导致土壤及茄子硝酸盐的污染，施用的有机肥的质量应符合国家规定的无害化卫生标准。
茄子无公害生产中，禁止施用硝态氮肥。如硝酸铵、硝酸钙、硝酸钾及含硝态氮的复合肥料。硝态化肥容易使土壤和茄子果实中积累较多的硝酸盐，影响土壤质量和茄子品质。另外禁止施用未腐熟的人畜禽粪便。粪便中含有大量致病菌、寄生虫卵和病毒等病原体，不经处理直接施用，将会造成不同程度的生物污染，既不卫生，也对人体健康有害。因此，人畜禽粪便必须经过无害化处理后才能施用。