在充分施用有机肥的前提下，应根据土壤肥力和产量目标施用氮磷钾肥，注意控制氮肥用量，增施磷钾肥。产量水平200公斤/亩以上的，建议施氮肥（N）11～13公斤/亩，磷肥（p2O5）4～6公斤/亩，钾肥（K2O）7～9公斤/亩，硼砂1公斤/亩；产量水平100～200公斤/亩的，建议施氮肥（N）8～10公斤/亩，磷肥（p2O5）3～5公斤/亩，钾肥（K2O）5～7公斤/亩，硼砂0.75公斤/亩。
适当增加施肥次数，可提高利用率。除基肥外，还要追施越冬肥、蕾薹肥和花肥；对于直播和套播油菜在冬季需要增加1次提苗肥。对于移栽油菜,氮钾肥总量60%作基肥、20%作腊肥（移栽后50天）、20%作薹肥（移栽后80天）；对于直播油菜，氮肥总量40%作基肥、30%作提苗肥（播种后25～30天）、15%作腊肥（播种后80天）、15%作薹肥（播种后110天），钾肥总量60%作基肥、30%作腊肥（播种后80天）、10%作薹肥（播种后110天），其余肥料作基肥施用。此外，注意基肥深施。以直播油菜为例，如只施于土壤表层，将引导油菜根系只长于土壤表层而不深扎，形成“浮根”，导致油菜扎根不稳，吸收土壤水肥能力下降，并易出现倒苗、脱肥、受旱等现象。