由于棉花打顶后，植株顶端生长优势已不存在，幼铃便成为养分最强的争夺者，如果满足不了它们的需要，便会被植株舍弃而脱落，而且养分不足还会造成幼蕾的脱落，这就需要补肥来解决。
棉花打顶后的肥料，可采用根际施肥和叶面喷肥相结合的方法进行补充，以氮、钾肥为主，缺磷土壤适当补施磷肥。按棉花高产要求，一般棉田以施7.5公斤尿素、7.5公斤钾肥为宜；肥沃的生茬地棉田和施有机肥多、有旺长迹象的棉田，要控制氮肥用量；徒长郁闭的棉田要严禁施用氮肥，可增施钾肥和磷肥，以消耗多余的氮。棉花打顶后补肥绝不是可有可无的工作，而是事关棉花产量高低的重要措施。