增施基肥在农家肥料中，以猪粪对大豆增产效果最好，其次是含有机质较多的马粪和堆肥，土杂肥的效果较差。基肥的施用量因粪肥质量、土壤肥瘠和前茬作物施肥多少等具体情况而定。一般粪肥质量高的，每亩施1000～1500公斤，质量差的，每亩施2000～3000公斤。土壤瘠薄和前茬施肥数量少的地块，更应注意多施有机肥。
用好种肥薄地施种肥常需加少量氮肥，每亩施尿素10或硝酸铵10～15公斤混合施用时，氮磷配合比例以1∶3或1∶2为好。施种肥时，要特别注意肥、种隔离，避免种肥接触，以免烧种烧苗。种肥深施有明显增产效果。
叶面喷肥花期用0.2%～0.3%的磷酸二氢钾水溶液或过磷酸钙浸出液叶面喷施，可增加籽粒含氮率，有明显增产作用；花期喷施0.1%的硼砂、硫酸铜、硫酸锰水溶液可促进籽粒饱满，增加大豆含油量。