当前大豆施肥上存在一些常见问题，如有机肥施用量少、未接种根瘤菌剂、忽视大豆钙镁硫硼钼等中微量元素营养等。大豆测土配方施肥应该采取重施有机肥，接种大豆根瘤菌，对缺乏中微量元素的土壤，有针对性的施用中微量元素肥料。
备肥总量：有机肥料施用量每亩2000公斤左右。亩产水平150公斤以下，亩施氮肥8公斤，磷肥4公斤，钾肥5公斤；亩产水平150～200公斤，亩施氮肥7公斤，磷肥3.5公斤，钾肥4.5公斤；亩产水平200公斤以上，亩施氮肥6公斤，磷肥3公斤，钾肥4公斤。
播种前用大豆根瘤菌剂拌种。每亩施用钙肥50～100公斤。对缺硼、钼的土壤分别在苗期和始花期用0.1%的硼砂和钼酸铵叶面喷施。
施肥比例：100%的有机肥和磷肥以及50%的氮、钾肥结合整地作基肥施用，施后将肥料耙入土中，使其土肥融合。30%的氮肥和钾肥作苗肥追施。20%的氮肥和钾肥作花前肥追施，追肥时先在两行大豆之间挖深度为15～20厘米的施肥沟，然后施肥覆土。