水稻重大病虫害台风暴雨可能导致水稻叶片遭受损伤，有利于病害侵染流行，水稻“两迁”害虫可随降雨大量迁入，导致田间虫量突增，要及时开展施药预防或控制。针对细菌性条斑病、白叶枯病、细菌性基腐病等细菌性病害，及时喷施噻唑锌或噻霉酮等药剂进行预防。针对稻瘟病、纹枯病，可选用三环唑、春雷霉素、枯草芽孢杆菌等药剂进行防治。针对稻飞虱，当田间虫量达到分蘖至孕穗期百丛虫量1000头、穗期百丛虫量1500头的防治指标时，要抢晴喷施杀虫剂防治，药剂可选用三氟苯嘧啶、氟啶虫胺腈、烯啶·吡蚜酮、金龟子绿僵菌等药剂。针对稻纵卷叶螟，当田间虫量达到分蘖期百丛水稻束叶尖150个、孕穗后百丛水稻束叶尖60个的防治指标时，可选用乙基多杀菌素、多杀菌素、茚虫威、四唑虫酰胺、苏云金杆菌等药剂进行防治。施药防治时，可以结合喷施赤·吲乙·芸苔、芸苔素内酯、冠菌素等植物生长调节剂，增强水稻抗逆性。
