贮藏库或器具要严格检查与消毒。仓库必须彻底清扫，消除仓内所有的缝隙和孔洞，消灭潜伏的虫鼠，并用石灰进行粉刷，使天棚、地板、四壁干净亮敞，然后利用烟雾剂或熏蒸剂进行彻底消毒。保证仓房无异种粮、无仓虫、无农药化肥污染等情况。
收割、脱粒、干燥、清选、分级后稻谷按品种、品质、水分等情况分批分级贮藏保管。
稻谷贮藏按堆存方式可采用散装或袋装，散装适于大量保藏和长期贮藏的情况；袋装适于品种多、贮藏量少和短期贮藏的情况。
如水分达到安全水分以下，则采用非字形或半非字形的实垛堆桩法，堆高袋数一般可达到10～12袋。如稻谷水分较高，又值秋冬降温季节，应采用通风垛或风凉桩，保持麻袋间留有较大空隙，便于通风散温散湿。常用堆存方式有金钱孔形及井字形等，堆放高度宜低，一般适于临时性的短期保藏。