看饱满度杂交稻种子由生活力较弱的不育系和恢复系杂交而成，加之多种因素的影响，杂交稻种子的饱满度不如常规稻种子。
看柱头痕迹杂交稻种子柱头外露，常规稻种子柱头不外露。
看外稃痕迹杂交稻种子的外稃和内稃交界处有一个小黑圆点，常规稻种子则无黑点。
看稃壳颜色杂交稻种子稃壳略带黄褐不均匀的生物性杂色，常规稻种子颜色较为单一。
看种子形状一般籼优稻杂交种子细长，粳稻种子较圆。杂交稻种子的腹部呈凹形，而非杂交稻种子腹部呈直线形。
看种子内外稃吻合度一般杂交稻种子的内外稃吻合度差，部分杂交稻种子的种尖容易开裂，而常规稻种子的种尖一般无开裂现象。
看谷壳厚度剥开谷壳观察，杂交稻种子的谷壳较薄，常规稻种子的谷壳较厚。
看稃内颜色将稻种用手剥开外稃，稃壳内有1--4枚瘦小干秕的黄色花药残迹的是杂交稻。