一是土壤因素。
土壤瘠薄，耕作层较浅，蓄水保肥能力差的地块玉米缺粒往往发生严重；
二是营养因素。
单一施用化肥，不施或少施农家肥，且氮、磷、钾配比不当，尤其是土壤中磷肥、硼肥不足，或玉米生育中后期，即开花灌浆期水肥供应不足，影响有机质的合成与运转，使玉米吐丝较晚，田间花粉减少，花粉、花丝寿命缩短，致使玉米缺粒；
三是气候因素。
（1）高温干旱。玉米生长中期连续干旱，造成多次卷叶，或开花时遇到高温干旱天气，土壤水分供应不足，影响了玉米雌、雄穗的发育，造成部分花粉败育或形成畸形花粉，影响受精，形成空粒。开花抽穗期是玉米的水分临界期，对缺水特别敏感，影响到雌穗发育，延缓雌穗抽丝，造成授粉不好。高温干旱容易使雌穗花丝枯萎，丧失生活力，造成结实率不高。
（2）阴雨天气。玉米开花灌浆期连续阴雨，花粉易吸水成团，影响散粉、授粉或花粉粒吸水过多而破裂死亡。
（3）风力。玉米是异花授粉的作物，主要靠风和昆虫实现花粉传播。玉米开花授粉期风力过大或无风都可不同程度影响授粉，进而影响结实；
四是栽培管理。
管理粗放，种植密度过大也可影响玉米缺粒的发生；
五是病虫危害。
在玉米生长的各个阶段，病虫害的发生都可不同程度地影响玉米的生长发育，造成玉米生长不良，尤其是玉米蚜在玉米抽雄时大发生，使玉米不能正常开花授粉，也会造成缺粒现象的发生。