据了解，赤霉病在小麦各生育期均能发生，引起苗枯、基腐、秆腐和穗腐，其中以穗腐发生最为普遍和严重，其次是秆腐，苗腐发生不明显。秆腐多发生在穗下第一、第二节，病初在叶鞘上出现水渍状褪绿斑，后扩展为淡褐色至红褐色不规则斑或向茎内扩展，病情严重时造成病部以上枯黄，小麦灌浆后期从发病部位以上死亡，病株易折断。气候潮湿时病部表面可见粉红色霉层。
据陈怀谷介绍，秆腐在小麦上每年都有发生，一般发病不严重，田间病株率也不高。小麦抽穗前期降雨偏多时，病菌随雨水沿叶鞘流入穗下1—2节处，导致秆腐发生。赤霉病菌在小麦抽穗前和抽穗后侵人均会造成秆腐症状，从生产上的发病情况看，以抽穗前侵入引起秆腐较多。今年小麦抽穗扬花期阴雨天多，是造成小麦秆腐发生的重要原因。
防治小麦赤霉病的最佳时期是在小麦抽穗扬花期，而造成秆腐症状病菌的侵入时期多在小麦抽穗期前，如果小麦抽穗前遇连阴雨天气，应将防治时间提早到抽穗期至齐穗期。药剂可选用多菌灵、福美双、甲基硫菌灵、戊唑醇、氰烯菌酯、咪鲜胺等。
在正常年份防治小麦赤霉病，抓住抽穗扬花期的最佳时期，用多菌灵、福美双、甲基硫菌灵等药剂及其复配剂就有较好的预防效果。小麦抽穗扬花期阴雨天多的特殊年份，最好选用氰烯菌酯、咪鲜胺等药及其复配剂防治，并连续用药两次，以确保防效。