1.机械清除法。主要是通过清扫、洗刷、通风、过滤等机械方法清除病原体。此法较常用，但达不到彻底消毒的目的，只能作为一种辅助方法，必须与其它消毒方法配合采用。
2.物理消毒法。采用阳光、紫外线、干燥、高温、蒸煮等方法，杀灭细菌和病毒。消毒效果较可靠，常采用。
3.化学消毒法。用化学药物杀灭病原是最为常用的方法。选用消毒药物应满足如下要求：①杀菌广谱，有效浓度低，作用快，效果好。②无味，无臭，对人、畜无害，使用后残留量少或副作用小，不损坏被消毒物品。③性质稳定，易溶于水，不易受其它理化因素影响。④来源容易，使用方便，价廉。
4.生物消毒法。常用该法将被污染的粪便堆积发酵，利用嗜热细菌繁殖时产生高达70℃以上的热，经过1～2个月可将病毒、细菌、寄生虫卵等病原体杀死。但此法不适用于炭疽、气肿疽等芽孢病原体，这类疫病的粪便应焚烧或深埋。
消毒的实施
1.定期性消毒。整个牛场每年彻底消毒2～4次，春、秋季必须各进行1次。牛舍内一切用具应每月最少消毒1次。方法如下：①对牛舍地面及粪尿沟可选用下列药物消毒：5%～10%热碱水、3%苛性钠、3%～5%来苏儿溶液等喷雾消毒，用20%生石灰乳粉刷墙壁。②饲养用具、牛栏、牛床等以5%～10%热碱水或3%苛性钠溶液或3%～5%来苏儿洗刷消毒。③运动场清扫干净，除净杂草后，用5%～10%热碱水或撒布生石灰消毒。
2.临时性消毒。牛群中检出并剔出结核病、布氏杆菌病或其它疫病牛后，相关牛舍、用具及运动场须进行临时性消毒。方法是：①布氏杆菌病牛发生流产时，必须对流产物及污染的地点和用具彻底消毒。②病牛的粪尿应堆积在距离牛舍较远的地方，进行生物热发酵后，方可充当肥料。③产房每月消毒1次，分娩室在临产牛生产前及分娩后各消毒1次。④凡属患布氏杆菌病、结核病等疫病死亡或淘汰牛，必须在兽医防疫人员指导下，在指定地点剖解或屠宰，尸体应销毁并深埋。处理完毕后，应对在场工作人员、场地及用具彻底消毒。