小麦根腐病是近年来黄淮麦区普遍发生的病害之一，对小麦的生产影响极大，尤其是多雨年份和潮湿地区发生更重。小麦根腐病在小麦各生育期均能发生，苗期形成苗枯，成株期形成茎基枯死、叶枯和穗枯。病原菌为禾旋孢腔菌，通过种子带菌以及小麦病株残体越冬、越夏进行传播，可通过以下措施进行防治。
1.药剂拌种。用种子重量0.3%的50%福美双或种子重量的0.03%的15%三唑酮或种子重量的0.2%的2.5%适乐时悬浮种衣剂进行种子包衣，对苗期小麦根腐病防效达75%以上。
2.选用抗病品种。种植时应选用高抗根腐病的优良品种。
3.农业防治。做好合理轮作、土壤深翻，加强田间管理，减少病原菌基数，增强植株抗病能力。
4.药剂防治。在发病初期及时喷药进行防治，可选用15%三唑酮(粉锈宁)或25%敌力脱每亩用药10克喷雾，或25%丙环唑每亩用药50克兑水20-30公斤喷雾，也可用多菌灵、苯醚甲环唑按说明喷施。