胃肠道功能障碍养殖中通常可遇到由于饲料脂肪氧化，黄曲霉毒素、饲料投喂量过大，拌料药物刺激引起胃肠道黏膜细胞受损，导致胃肠道功能紊乱、消化不良等现象。
易出现白便、稀黏便或粪便不成型、粪便恶臭等症状。
肝胆或肝胰腺功能障碍因胃肠道功能紊乱、饲料投喂量过大、有害藻类中毒、拌料药物中毒，水质有害物质中毒等原因，引起肝脏、肝胰腺生化指标出现异常，肝胆代谢功能紊乱。
表现症状为厌食不长，体型发黑消瘦、肝胆或肝胰腺肿大、色泽暗红或光泽度差等。
心脏、血液循环障碍由于气候环境如阴雨连绵时间久，台风暴雨，气温气压变化，水温水压等应激导致对虾出现游边、跳水、抽筋、游动加速或者减慢，也可导致神经肌肉系统出现反常现象。
免疫功能障碍由于苗种、饲料、药物、气候、水质等多方面因素，在高密度养殖下，鱼虾容易在连续阴雨、气压低、温差大、倒藻后生病、也抵抗不住气候、运输、筛分、倒池、换箱、搬塘等操作折腾。
出现无特殊症状的掉头，减量，甚至陆续死亡等。
营养吸收功能障碍营养过剩或缺少天然活性物质，导致对虾营养不良，如气候炎热时缺钾，可以导致虾苗黑瘦、干吃不长，肌肉松弛，缺钙、镁可导致对虾软壳，脱壳不遂等症状出现。
水质功能障碍pH值不稳定，藻类不均衡，倒藻，藻毒素中毒，氨氮，亚盐高。底质缺氧，水体微量营养物质缺乏，水体循环代谢功能紊乱，自净能力低。条件致病菌随环境改变大量增值等。
鱼虾群体出现不安，减料，活力弱，再加环境突变，容易暴发感染性死亡疾病。