在鱼苗培育中，常遭受一些水生动物和藻类的危害，严重影响苗种成活率，造成重大损失。
一、甲虫：种类较多，常在水边泥土内筑巢栖息，白天隐居于巢内，夜晚或黄昏时出来活动觅食，捕食大量鱼苗。防治：每立方米水体用90%晶体敌百虫0.5克溶解后对水全池泼洒。
二、水斧：扁平细长，体长35-45毫米，全身黄褐色。它们用口吻刺入鱼体吸食血液而致鱼苗死亡。防治：每立方米水体用90%晶体敌百虫0.5克溶解后对水全池泼洒。
三、水螅：一般附着于池底石头、水草、树根或其他物体上，在其繁殖旺期大量吞食鱼苗，危害较大。防治：清除池水中水草、树根、石头及其他杂物，不让水螅有栖息场所，使其无法生存；如有发生，全池泼洒90%晶体敌百虫溶液，剂量同上。
四、水蜈蚣：是龙虱的幼虫，5-6月大量繁殖时，1只水蜈蚣一夜间能夹食10多尾鱼苗，危害极大。防治：用竹木搭成方形或三角形框架，框架放置少量煤油，天黑时点燃油灯或电灯，水蜈蚣会趋光而至，接触煤油后窒息死亡。
五、藻类：消耗池中大量养分使水质变瘦，影响浮游生物的正常繁殖。大量繁殖时，严重影响鱼苗活动，鱼苗常被乱丝缠绕致死。防治：⑴勤换水。每隔1-2年就应清塘换水1次，注意选择优质的水源。⑵在日常投喂饲料时，尽量投喂利用率较高的颗粒饲料，避免投喂粉末状饲料而污染水体。⑶当水体中有大量的藻类时，可用筛网将其打捞出来，最好不要使用化学药品。