水蚯蚓的繁殖能力极强，一般引种后15～20天即出现大量幼蚓，1个月后就可采收。采收水蚯蚓前1天晚上断水或减小水流，使池水缺氧，迫使水蚯蚓离开泥层成团聚集，第二天黎明时用聚乙烯小抄网舀取水中蚓团即可。一般日采收量为每平方米50～80克，这样的采收量既不影响其群体繁殖力，也不会因采收不及时导致蚓体衰老死亡而降低产量。
水蚯蚓捞出后先清洗体表泥污，然后置微流水中暂养，使其排净消化道内的食物、粪便。每平方米池面暂养水蚯蚓10～20千克，每3～4小时定时搅动分散1次，以防水蚯蚓结集成团缺氧死亡。暂养时间不宜超过2天。
用水蚯蚓投喂塘虱鱼前，先用清水洗净，投喂时再用高锰酸钾消毒处理，浓度为每立方米水体用药20克，以防止水蚯蚓带入病菌致使鱼苗得病。