鱼病防治工作直接关系到水产养殖效益的高低，在养殖过程中，许多养鱼户由于不注意科学选用、配制和使用鱼药，给养殖生产带来不必要的损失。
正确选药
1.查清病因。选择用药前，要请渔技专业人员详细诊断病因。鱼病发生的原因有病原、寄主、环境三种主要因素，它们相互作用失去平衡，就会引起鱼类发病。要想达到治病的目的，首先应分析研究病因，才不致贻误病情，对症治疗。
2.合理选药。生产中要选择使用经国家认证的正规渔药厂家生产的绿色无公害渔药，选药时详细阅读药物使用说明，遵照医师嘱咐，并注意药物生产日期、保质期及使用方法。严禁使用高毒、高残留或具有致癌、致畸、致变态的鱼药。严禁使用对水域环境严重破坏而又难修复的鱼药。
3.对症择药。掌握了病因，还需对照症状在专业医师指导下选择用药，若是仅靠道听途说的“偏方”或一般性的经验之谈，或听取“水货”鱼医的意见，盲目下药，势必于事无补，甚至会贻误时机加重病情。
科学用药
1.注意用药时机。采用全池泼洒药物，要选择晴天在上风处泼洒，时间在上午10时或下午5时，泼药后应观察2小时以上。另外，气温超过38℃时，害虫停止摄食，此时施药，药液易挥发，且达不到防治效果。又如施用漂白粉，因其效应快，应在鱼发病高潮将来之前使用，效果最佳。鱼用药后1～2小时内，人不要离开池塘边，一旦发现鱼严重浮头或有死鱼时，应迅速注入新水。鱼在浮头时或浮头刚结束时不宜用药，否则会造成大批鱼死亡。遍洒药物应从上风处开始逐步向下风泼，这样药物较均匀。
2.注意用药温度。药物在不同的温度条件下药效有较大差异，水温升高，药物的毒性增强。同时有少数药物对溶解水的温度要求严格，如硫酸铜需60℃左右的温水才能溶化，但温度过高，硫酸铜就会失效。
3.巧用中草药。中草药是一种环保型绿色药物，如防治病毒性鱼病的中草药有大黄、黄柏、黄芩、大蒜等；防治细菌性鱼病的有乌桕、五倍子、菖蒲、柳树枝等；防治真菌类鱼病的有五倍子、菖蒲、艾叶等；防治寄生虫类鱼病的有马尾松叶、苦楝树叶、乌桕叶、桉树叶、干辣椒、生姜等。由于中草药的季节、产地、泡制方法不同，其有效成分含量差异较大，且属于粗制型产品，其剂量难以把握，故经验数据很重要。