水霉病初发即病菌刚寄生鱼体（卵）不久时，肉眼一般难以看出病鱼（卵）异样，而当肉眼能看到时，病菌丝已侵入鱼机体内或卵膜内，大量繁殖向内外生长，成为灰白色的旧棉絮状物覆于病鱼（卵）体表，并分泌酵素分解鱼组织，使鱼卵胚胎发育中止；使病鱼患处肌肉腐烂，行动迟缓，食欲减退而死亡，给养殖生产带来较大经济损失。
此病一般发生在20℃以下的低水温环境，在早春、晚冬最容易流行。水霉菌对寄主无严格选择性，各种养殖鱼类从鱼卵到成鱼均容易被感染。密养越冬池中的鱼类、春季清瘦水体的鱼类或处于饥饿状态下的鱼类最易患水霉病。春季投放鱼种时，如果操作不当也会引起水霉病的暴发。防治水霉病以消毒为主。可以选择一些较温和的消毒剂给水体消毒，投放一些沉水性的颗粒底改剂，再使用些杀水霉菌的药物。具体方法是：
一、鱼类入池操作过程中要尽量仔细，勿使鱼体受伤。
二、入池前用3-5%的食盐水溶液浸泡鱼种8-10分钟。避免在水温15℃以下的条件下处理养殖鱼类，以免鱼体冻伤或擦伤。
三、如果发现鱼类已感染水霉病，可把食盐和小苏打按照3∶1的比例混合，以1毫克/升的浓度全池泼洒；情况较严重的适当增加用量。
四、受伤亲鱼可用4%磺酒涂抹患部；鱼卵可用4%福尔马林浸洗2-3分钟。